2007년 07월 10일
Molecular structure of Nucleic Acids

현대의 생물학... 특히  Molecular Biology에서 James Watson 과 Francis Crick의  MOLECULAR STRUCTURE OF NUCLEIC ACIDS - A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid 를 논하지 않을 수없다.


자연과학을 하는 사람들이라면 전공과 관계없이 한번쯤을 들어봤을테고, 또 읽어 봤을 논문이다.

(그런데 원문 보기는 수월치 않다... Nature란 녀석들은 원문을 보려면 Money를 요구한다...)

전에 원문 pdf파일을 구해서 네이버 블로그에 올려놨었는데, 이글루스로 옮겨볼까하고 들어가봤더니 파일을 찾을 수 없다고 나온다. 흠..

그래서 스캔 파일을 올려본다.. 

선생님들이 말씀하시듯, 원전이 되는 논문들은 간단하고, 간결하기 때문에 처음 원서를 보는 사람들(학부생들 정도 되려나?...)
도 쉽게 이해 할수 있다. ( 그런데 난  Molecular 쪽은 정말 쥐약이다.. ㄷㄷ)


이 논문을 처음 해석 했을때가 학부 3학년 때였으니.. ( 복학한지 얼마 안지나서 인지 애먹었던 기억이난다..)

벌써 횟수로.. ㄷㄷ

시간 빠르다..

논문의 내용은  잘알겠지만

 


Molecular structure of Nucleic Acids

핵산의 분자구조


A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid

 DNA(디옥시리보 핵산)의 구조


We wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (D.N.A.).

우리는 DNA의 구조에 대하여 약간의 의심을 하고 있다.

This structure has novel features which are of considerable biological interest.

이 구조는 상당한 생물학적 흥미가 있는 기발한 구조로 되어있다.

A structure for nucleic  acid has already been proposed by Pauling and Corey.

핵산의 구조는 이미 Pauling과 Corey에 의해서 제안되었었다.

They kindly made their manuscript available to us in advance of publication.

그들은 친절하게도 그들의 원고를 공공의 목적을 위해 우리에게 사용 가능하도록 하였다

Their model consists of three intertwined chains, with the phosphates near the fiber axis, and the bases on the outside.

그들이 제안한 모델은 섬유 축 가까이에 인산기를 가지고 서로 얽힌 세 개의 사슬로 구성되어 있으며 바깥쪽에 염기를 두고 있다.

In our opinion, this structure is unsatisfactory for two reasons:

우리의 견해로는 이 구조는 다음 두가지의 이유에서 불만족스럽다.  

(1) We believe that the material which gives the X-ray diagrams is the salt, not the acid.

(1) 우리는 엑스레이 촬영 사진의 구조는 산이 아니라, 염이라고 생각한다.

Without the acidic hydrogen atoms it is not clear what forces would hold the structure together, especially as the negatively charged phosphates near the axis will repel each other.

산을 만드는 수소 원자를 제외하고 어떤 힘이 구조를 유지하는지 분명하지 않다. 특히 축 가까이에 음전하로 대전된 인산기들은 서로 반발할 것이다.

(2) Some of the van der Waals distances appear to be too small.

(2) 반데르발스 거리가 매우 작은 것 같이 보인다.

Another three-chain structure has also been suggested by Fraser (in the press).

다른 세 개의 사슬 구조가 Fraser에 의해 제안되어 지기도 하였다.

In his model the phosphates are on the outside and the bases on the inside, linked together by hydrogen bonds.

그가 제안한 모델은 인산이 바깥쪽으로 되고 염기는 안쪽으로 되어 수소 결합으로 연결되어있다.

This structure as described is rather ill-defined, and for this reason we shall not comment on it.

이 구조는 오히려 더 부실하게 규정되어 있기 때문에 이 이유에서 우리는 언급하지 않겠다

We wish to put forward a radically different structure for the salt of deoxyribose nucleic acid.

우리는 염기의 디옥시리보스 핵산의 근본적으로 다른 구조를 제안하려한다.

This structure has two helical chains each coiled round the same axis.(see diagram)

이 구조는 2개의 나선형의 사슬로 각각의 꼬임은 같은 축으로 회전한다.(그림참조)

We have made the usual chemical assumptions, namely, that each chain consists of phosphate diester groups joining ß-D-deoxyribofuranose residues with 3',5' linkages.

우리는 보통의 화학적 가정을 세웠다. 즉 그 각 사슬은  3‘, 5’ 결합을 가진 β-D 디옥시리보 5탄당 단위에 결합되어 있는 인산기로 구성된다.

The two chains (but not their bases) are related by a dyad perpendicular to the fibre axis.

두 사슬(그것들의 염기는 아님)은 섬유 축에 수직인 한 쌍으로 연결되었다.

Both chains follow right- handed helices, but owing to the dyad the sequences of the atoms in the two chains run in opposite directions.

양쪽의 사슬 모두 우선형 나선이나, 두 사슬의 각쌍의 분자 배열은 반대방향으로 이어져 있다.

Each chain loosely resembles Furberg's model No. 1; that is, the bases are on the inside of the helix and the phosphates on the outside.

각 사슬은 대충 Furberg의 모델 1과 비슷하다. 그것은 염기는 나선의 안쪽에 있고, 인산기는 바깥쪽에 있다는 것이다.

The configuration of the sugar and the atoms near it is close to Furberg's 'standard configuration', the sugar being roughly perpendicular to the attached base.

당과 원자의 분자 배열은 Furberg의 ‘표준 분자 배열’에 근접한데, 당은 대강 부착된 염기에 수직인 곳에 있다.

There is a residue on each every 3.4 A. in the z-direction. We have assumed an angle of 36° between adjacent residues in the same chain, so that the structure repeats after 10 residues on each chain, that is, after 34 A. The distance of a phosphorus atom from the fibre axis is 10 A.

Z 방향으로 3.4 A마다 한 단위가 있다. 우리는 같은 사슬 안에서 인접한 두 단위의 각을 36도로 가정했다. 그래서 각 사슬마다 이 구조가 10개의 단위씩 즉 34A 만큼 반복된다.  인 원자부터 섬유 축까지의 거리는 10A이다

As the phosphates are on the outside, cations have easy access to them.

그래서 인산기는 바깥쪽에 있고 양이온은 그것에게 쉽게 접근한다.

The structure is an open one, and its water content is rather high.

그 구조는 열린 구조이며, 그것의 수분 함량은 오히려 높다.

At lower water contents we would expect the bases to tilt so that the structure could become more compact.

수분함량이 낮을 때는 그 구조가 더 촘촘해지기 위해서 염기가 기울어 질 것으로 예상한다.

The novel feature of the structure is the manner in which the two chains are held together by the purine and pyrimidine bases.

이 구조의 새로운 특징은 두 개의 사슬이 퓨린과 피리미딘 염기로 서로를 잡아주는 방법이다.

The planes of the bases are perpendicular to the fibre axis.

염기의 면은 섬유 축에 수직으로 되어있다.

They are joined together in pairs, a single base from one chain being hydrogen-bonded to a single base from the other chain, so that the two lie side by side with identical z-co-ordinates.

그들은 쌍으로 서로 결합하며, 한 사슬의 하나의 염기가 다른 사슬의 하나의 염기와 수소결합을 해서 두 개의 면이 나란히 동일한 z-co-세로좌표에 위치하게 된다.

One of the pair must be a purine and the other a pyrimidine for bonding to occur.

쌍의 하나는 반드시 퓨린이며, 나머지 하나는 피리미딘이어야 연결할수 있다.

The hydrogen bonds are made as follows : purine position 1 to pyrimidine position 1 ; purine position 6 to pyrimidine position 6.

수소 결합은 퓨린의 위치 1이 피리미딘의 위치 1로, 퓨린의 위치 1이 피리미딘 위치 6으로 따라 가는 것처럼 만든다.

If it is assumed that the bases only occur in the structure in the most plausible forms (that is, with the keto rather than the enol configurations) it is found that only specific pairs of bases can bond together.

만약 염기가 대부분의 그럴듯한 토토머화 형상안에서만 구조가 형성된다고 가정한다면,( 즉케톤기가 에놀기보다 낫다면) 몇몇의 특수한 쌍들의 염기만이 서로 연결된다는 것을 알수 있다. 

These pairs are : adenine (purine) with thymine (pyrimidine), and guanine (purine) with cytosine (pyrimidine).

이 쌍들은 아데닌 (퓨린) 과 티민(피리미딘), 구아닌 (퓨린) 과 시토신 (피리미딘)이다.

In other words, if an adenine forms one member of a pair, on either chain, then on these assumptions the other member must be thymine ; similarly for guanine and cytosine.

달리 말하자면, 만약 아데닌 염기가 어떤 사슬에서 쌍의 구성물질이라면, 다른 하나의 쌍은 티민이라고 우리가 예상할 수 있는 것이다. ;구아닌과 시토신도 비슷하다.

The sequence of bases on a single chain does not appear to be restricted in any way.

하나의 사슬에서 염기 배열은 어느 방법으로도 제한되어 보이지 않는다.

However, if only specific pairs of bases can be formed, it follows that if the sequence of bases on one chain is given, then the sequence on the other chain is automatically determined.

그러나 특정한 짝 염기가 형성될 수 있다면 그것은 만약 하나의 사슬에서 염기 서열이 주어진다면 다른 사슬의 서열은 자동적으로 결정되는 결과를 가져온다.

It has been found experimentally  that the ratio of the amounts of adenine to thymine, and the ration of guanine to cytosine, are always very close to unity for deoxyribose nucleic acid.

그것은 아데닌의 양과 티민의 양의 비율과 구아닌과 시토신의 비율이 합쳐진 디옥시리보 핵산에서 거의 비슷하게 나온다는 점에서도 알수 있다.

It is probably impossible to build this structure with a ribose sugar in place of the deoxyribose, as the extra oxygen atom would make too close a van der Waals contact. 

그것은 아마도 여분의 산소 원자가 반데르발스 결합을 매우 근접하게 함으로써 디옥시리보의 위치에서 리보스 당으로 그 구조를 만드는 것을 불가능하게 하는지도 모른다.


The previously published X-ray data (5,6) on deoxyribose nucleic acid are insufficient for a rigorous test of our structure.

이전에 출판된 DNA의 X-ray 데이터는 우리의 구조에 대한 정밀한 실험을 위해서는 충분하지 못하다.

So far as we can tell, it is roughly compatible with the experimental data, but it must be regarded as unproved until it has been checked against more exact results. Some of these are given in the following communications.

우리가 말할 수 있는 한, 실험적인 데이터에 있어서는 모순이 거의 없다. 그러나 더 정확한 결과가 확인될 때까지는 증명되지 않은 것으로 간주되어야 한다.

We were not aware of the details of the results presented there when we devised our structure, which rests mainly though not entirely on published experimental data and stereochemical arguments.

이런 것들 중에는 잇따른 논의가 주어지는 것도 있다. 우리의 이 구조를 고안했을 때 현재 나타난 이 결과의, 출간된 실험적인 데이터와 입체화학적 입장에 전적으로 의존할 것이 아닌, 세부적인 면은 알지 못했다. 

It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material.

우리가 가정한 특별한 염기쌍들은 즉시 유전물질의 가능한 복제 메커니즘을 제안하였으며, 이는 우리의 주장을 벗어날 수는 없다.

Full details of the structure, including the conditions assumed in building it, together with a set of co-ordinates for the atoms, will be published elsewhere.

그것이 만들어지는 가정된 조건과 원자에 대한 대등한 구조를 함께 가진다는 것을 포함한 이 구조의 모든 세부사항은 다시 다른 면에서 언젠가 발표될 것이다.

We are much indebted to Dr. Jerry Donohue for constant advice and criticism, especially on interatomic distances.

 우리들은 끊임없는 조언과 비판을 해준 Dr. Jerry Donohue에게, 특히 원자 상호간의 거리에 있어서 신세를 졌다.

We have also been stimulated by a knowledge of the general nature of the unpublished experimental results and ideas of Dr. M. H. F. Wilkins, Dr. R. E. Franklin and their co-workers at King's College, London. One of us (J. D. W.) has been aided by a fellowship from the National Foundation for Infantile Paralysis.

우리는 런던의 king's 대학에 있는 M. H. F Wilkins 박사와 R. E.  Franklin 박사, 그리고 그들의 동료들의 미발표된 유전적 원천에 대한 실험 결과와 의견에 대한 지식에 의해 고무되었었다. 우리들 중 한 명(J. D. W.)은 'NFIP'으로부터 도움을 받았다.

by 바리엔테 | 2007/07/10 22:13 | 재미난 논문 | 트랙백(1) | 덧글(10)
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Tracked from 월풍도원(月風道院) -.. at 2010/07/29 01:31

제목 : [생명공학] 단백질 구조, 몰(.MOL) 파일 구조..
이미지출처 : czechabsinthe.wordpress.com 몰(.MOL) 파일의 대략적인 구조 (BT .MOL FILEFORMAT)는 다음과 같다. [Header] {3Line} 1: Name - 구조이름 2: IIPPPPPPPPMMDDYYHHmmddSSssssssssssEEEEEEEEEEEERRRRRR (FORTRAN: A2[–A8–][—A10–]A2I2[–F10.5-][—F12.5–][-I6-] ) User’s first and las......more

Commented by 매치어 at 2007/07/10 23:20
!!! 이런 무시무시한 내용을 올리시다닛... 한국어와 영어가 어순이 달라서 번역하기 어려우셨을텐데... 역시 '자연' 잡지에 실린 거라 내용이 짧군요.
덧) 전 이쪽 이야기 볼 때마다 Franklin 박사가 불쌍하단 생각이 듭니다.
Commented by 다크초콜릿 at 2007/07/11 01:41
Franklin 박사가 요절한 것을 적절히 이용한 거죠. 과연 그녀가 살아 있었어도 순순히 받아들였을지는 의문입니다. 그녀의 전기문을 읽어보니 대단한 성격이었던 것 같은데... 뭐 어쨌든 뒤늦게라도 재조명이 되고 있으니 다행이라고 해야할지... 그러고 보니 제가 원글님도 아닌데 왜 건방지게 답변을 하고 있는걸까요? ^^; 죄송합니다...
Commented by 파군성 at 2007/07/11 02:19
...고 1때 생물선생이 '이것이야말로 생물의 진수다'라고 던져줬던 기억이 나네요(...)
-물론 영어라서 대충읽고 '나 생물 안해! ;ㅁ;'이러고 말았지만;
Commented by 대학생 at 2009/04/14 16:53
Commented by 대학생 at 2010/04/15 04:20
ㅠㅠ 엉엉엉 날가져요 너무너무너무너무너무너무너무 고마워요 ㅠㅠ 엉ㅇㅇ어어어어엉 이거찾느라 새벽네시까지 이짓거리하고있었음
Commented by 오우 at 2011/03/09 20:56
감사합니다~~~~~~~~~~ 좋은 자료 보고가요^.^
Commented by 대학생3 at 2012/03/18 13:13
어엉 ㅠㅠ 고마워여 이거 당장 어떻게 번역할지 막막했는데..
제가 영어실력이 꽝이라..^^
Commented by 대학생5 at 2014/09/23 22:09
후.. 성지순례합니다
Commented by 와사바라 at 2015/04/22 22:18
이게 끝인가요?? 첫장밖에 번역 안된것 같은뎅..
Commented by 고등학생 at 2016/11/22 20:28
좋은내용감사합니다.

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